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磷脂的性狀與來源、生產工藝、純度及保存條件都有關系。

純度低的天然磷脂為液體或膏狀,顏色較深,為棕黃色。純度越高,顏色變淺。達到80%左右純度的卵磷脂為淺黃色,采用凍干工藝的產品為膏狀固體,采用噴干工藝的產品為粉末狀。天然磷脂很難做到非常高的純度,目前,我國有批文的卵磷脂中以上海艾韋特的蛋黃卵磷脂PC-98T純度最高,PC純度可達到98%以上,產品為白色粉末。天然磷脂不飽和度高,因此無論使用或貯存多么小心,多少都會有氧化發生,其結果就是極易吸水,暴露在空氣中迅速變色、變粘。天然磷脂會有一種特殊的腥味。
合成磷脂純度一般都能達到90%以上,因此均為白色粉末狀固體,吸水性和氣味都比天然磷脂小的多,甚至無味。有些試劑級的磷脂會以有機溶液的形式貯存和出售,有利于磷脂保存和使用中的穩定性。
正常情況下,使磷脂發生氧化的氧化物為空氣中的氧氣。光照、溫度、金屬離子、未知雜質等都可成為氧化反應的催化條件,使氧化加劇。天然磷脂含有大量不飽和脂肪酸,雜質多,因此非常容易發生氧化。除避光、低溫以外,為避免磷脂氧化最重要的一點是隔絕氧氣環境。因為在有氧條件下,即使-20℃,密封保存,天然磷脂也很容易發生氧化變質,表現為磷脂顏色加深,氣味加重,過氧化值超標。

